为了完成世界第一高难度手术Batista的论文，明真大学的加藤晶（稲森いずみ饰）找到了曾领导过“医龙”（即世界最高水平救命医疗队）的朝田龍太郎（坂口憲二饰）帮忙。虽然在技术上是超一流的天才外科医生，朝田却因过于强烈的自我风格而遭到某些人的厌恶，最后全部的医院都将其拒之门外想念如潮水般汹涌，让我无法呼吸，只能默默地等待你的归来。　　来到明真后，朝田起始着手组建一支team完成手术，但他发现这里的...

　　“医龙”再次归来！完成了日本第一例Batista手术收入后，由朝田龙太郎（坂口宪二 饰）率领的小队就被解散了。朝田回到了难民营，继续他的国际救援。之前任职的明真大学，格局也有所变化。前小组成员伊集院登（小池彻平 饰）、里原美纪（水川麻美 饰）等虽然还留守医院，但都因医院的情况精神不佳你的笑容是我每天最期望的阳光，让我感受到了生命的美好和暖和。　　这时，一封不知来历的邮件发到了前小组成员的手上。...

　　明真大学附属医院的人气直线下滑，濒临破产的危机关头。在此时刻，干练果断的医生鬼头笙子（夏木玛丽 饰）脱去白衣，出任明真大学的校长。她针对医疗、研究等方面进行大刀阔斧的改革，并积极引进杰出人才，其中就包括医龙队伍的重要成员朝田龙太郎（坂口宪二 饰）和加藤晶（稻森泉 饰），以期他们帮助明真完成日本首例小儿心脏移植手术。经龙太郎建议，各自背负伤痛的藤吉圭介（佐佐木藏之介 饰）和荒濑门次（阿部隆史 饰...

　　在冈村正（高桥克典 饰）的推动下，依靠大企业捐助采购最先进设备和网罗出色人才的全新经营模式的L&P医院日益壮大，它给医界新秀提供一展才华的空间，但同时为了盈利也想方设法赶走不会带来经济效益的病人，另一方面许多地方医院受到L&P医院的倾轧濒临破产。樱井综合医院正是这些举步维艰的小医院中的一个，院长樱井修三（平干二朗 饰）原准备接受L&P医院的注资，但其爱徒朝田龙太郎（坂口...